2000년
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2월
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러시아 과학원과 학술교류협약
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3월
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농학과를 식물자원학과로 과명 변경
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2001년
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3월
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모집단위변경, 농학1군-식물자원연초학과군, 농학2군-축산농화학식품공학과군, 농학3군-농공농업기계공학군
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9월
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제 13대 김정화 농과대학장 취임
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농과대학 설립 50주년
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2002년
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3월
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모집단위명칭변경.
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농학1군 - 식물자원 연초학군
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농학2군 - 축산 농화학 식품공학과군
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농학3군 - 농공 농업기계공학과군
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2003년
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3월
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모집단위명칭변경
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식물자원 연초학군 -> 식물자원 연초학과군학과(전공)명칭변경
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식물자원학전공 -> 식물자원학과, 연초학전공 -> 연초학과, 축산학전공 -> 축산학과, 농화학전공 -> 농화학과, 식품공학전공-> 식품공학과, 농공학전공 -> 농공학과, 농업기계공학전공 -> 농업기계공학과
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9월
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제 14대 김내수 농과대학장 취임
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2004년
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3월
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모집단위명칭변경.
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환경생물원예학부 -> 식물의학 원예학과군
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학과(전공)명칭 변경, 원예학전공 -> 원예 학과, 농생물학전공-> 식물의학과, 임학전공 -> 산림학전공, 임산학전공 -> 목재종이과학전공, 농공학과 -> 지역건설공학과
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2005년
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1월
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일본 야마가타대학교와 교환학생 및 학술교류 협약 체결
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3월
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학명칭변경.
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농과대학 -> 농업생명환경대학모집단위명칭변경.
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식물자원 연초학과군 -> 식물자원 특용식물학과군, 식물의학 원예학과군 -> 식물의학원예과학과군, 농공 농기계공학과군 -> 지역건설바이오시스템공학과군학과(전공)명칭변경.
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연초학과 -> 특용식물학과, 원예학과 -> 원예과학과, 농업기계공학과 -> 바이오시스템공학과 부속기관 명칭변경.
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부속목장 -> 부속동물자원개발센터
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4월
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부속기관 명칭변경.
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부속연습림 -> 부속학술림
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9월
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제 15대 황주광 농업생명환경대학장 취임
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2006년
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3월
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모집단위 설,폐 및 모집단위 학과 명칭변경.
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산림과학부 폐지, 식물의학 원예과학과군폐지, 식물자원 특용식물학과군 폐지, 축산농화학 식품공학과군 폐지, 지역건설 바이오시스템공학과군 폐지
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생물자원생산학부 신설(식물자원학전공, 특용식물학전공, 바이오시스템공학전공), 산림과학 지역건설공학부 신설(산림학전공, 목재 종이과학전공, 지역건설공학전공), 응용생명환경학부 신설(농화학전공, 식물의학전공, 원예과학전공, 축산학 전공, 식품공학전공)
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7월
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농어촌공사 연수원과 산학협력 협정 체결
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2007년
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9월
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제 16대 석영선 농업생명환경대학장 취임
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12월
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케이티앤지 중앙연구원과 연구 기술교류에 관한 협약 체결
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2008년
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11월
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몽골울란바타르대학교와 교육과 학술교류 협약 체결
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12월
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몽골대학교와 교육 및 학술교류 협약 체결
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2009년
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생물자원생산학부, 산림과학지역건설공학부 해제(식물자원학과, 특용식물학과, 바이오시스템공학과, 산림학과, 지역건설공학과, 목재·종이과학과로 변경)
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9월
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제 17대 박종문 농업생명환경대학장 취임
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2010년
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응용생명환경학부 해제(축산학과, 농화학과, 원예과학과, 식물의학과, 식품공학과로 변경)우크라이나
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9월 8일
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제 2농학관(첨단바이오연구센터) 착공
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2011년
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모집단위 학과명칭 변경(농화학과→환경생명화학과로 변경)
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5월
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중국심양농업대학과 학술교류 협정 체결
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8월
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우크라이나 South Branch of National University와 학술교류 협정체결
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8월
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바이오시스템공학과 연광석 교수 정년퇴임
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9월
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제 18대 한충수 농업생명환경대학장 취임
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2013년
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9월
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제19대 송창섭 농업생명환경대학장 취임
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10월
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인도네시아 보고르(BOGOR)농업대학과 학술교류 협정 체결
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10월
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중국 연변조선족자치주 농업과학원과 학술교류 협정 체결
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10월 23일
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첨단바이오연구센터 개관
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2014년
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3월
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에티오피아 아다마 과학기술대학교와 학술교류 협정체결
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5월
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벨기에 궨트대학과 학술교류 협정체결
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7월
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2014년 지방대학 특성화사업선정(BT융합 농생명 6차산업화 인재양성사업단 단장-우선희 교수)
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9월
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중국 길림농업대학교와 학술교류 협정체결
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11월
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일본 사가대학교 및 도쿄농업대학교와 학술교류 협정 체결
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2015년
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6월
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한국임업진흥원과 산학협력 체결
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9월
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제20대 경기성 농업생명환경대학장 취임
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12월
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중국 연변대학 농학원 학술교류 협정체결
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2016년
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6월
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전국새농민회 충북도회 상호 협력 체결
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7월
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중국농업과학원특산연구소 학술교류 협정체결
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9월
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중국 화중 농업대학 학술교류 협약 체결
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2017년
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4월
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베트남 농업과학원 협약체결
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4월
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학술림 환경개선사업 준공식
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9월
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제21대 사동민 농업생명환경대학장 취임
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12월
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Indigenous and Frontier Technology Research Center(IFTR) 와 연구교류
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2018년
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3월
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산림생명자원 관리기관 협약체결
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4월
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청주소로리볍씨기념사업회와 업무협약 체결
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