본 연구소는 동물 생명과학 분야의 연구를 활성화하고, 충청 지역의 동물자원 산업인 축산업 발전을 위하여 충북대학교 농과대학 축산학과를 중심으로 2003년에 설립되었다.
본 연구소는 이 지역의 축산업 관련 업무의 국가기관 및 민간단체와의 협력 하에 지역 내 축산업 생산 현장의 애로를 해소하고 새로운 이론과 기술을 신속히 보급하는 기능을 수행한다. 아울러 현장의 문제를 교육에 반영함으로서 산학 협동을 통하여 충북 지역 축산업의 발전을 도모하며, 동물 유용유전자 분석, 복제 수정란 생산 보급, 그리고 사료개발과 가축 사양관리 관련 각종 수탁 사업을 수행하며, 연구기술 개발에 주도적인 역할을 하게 될 것이다.