국내 경제 및 사회의 선진화는 노동력의 급격한 감소를 초래하였고, 국내 농산물 시장의 개방화 압력은 농업의 구조 개선을 절실히 요청하고 있다. 따라서, 농업 생산성을 극대화하고, 농산물의 품질을 제고하기 위하여 바이오 관련 작업의 첨단기계화가 필요하다.

본 학과는 바이오 관련 작업의 첨단화에 관련된 학술적 이론과 응용방법을 교수, 연구 개발하여 우리 농촌의 농업생산 환경에 알맞은 농업생산, 가공, 에너지 활용과 관련된 기계화와 자동화 기술의 연구개발에 주력함은 물론, 국가 사회에 공헌할 수 있는 유능한 지도적 인재를 양성함을 목표로 한다. 또한, 과학기술의 세계적인 발전 추세에 부응하기 위하여 공학을 위한 기초과학과 바이오시스템공학의 첨단과학 기술과 관련된 교과목들을 설강하고 있다.