센터의 목표는 지역의 특화산업을 육성시키고 경쟁력 강화하여 환경친화적인 원예기술을 개발하는 것이다. 또한 대학의 연구역량 증대와 효율적 산학관연 체재를 구축하고 인력을 양성하는데 있다. 독자적 원천기술 개발로 기술우위를 확보하고 과학기술발전 도모하고자 한다. 첨단원예기술개발 등의 현장애로 기술 및 학연산 공동의 장기과제를 선정하여 연구하고 있으며, 개발된 기술을 산업화하고자 한다.

본 센터에서는 품목별 교육훈련과정 개설, 세미나 및 심포지엄 개최, 현장방문 및 토론회 개최, 식물체 수질 및 토양의 분석과 영양진단, 식물병원 등을 운영하고 있다. 또한 우수한 전문 인력의 양성하고 공급하여 산업체 인력의 재교육 및 대학원 교육, 대학원 및 대학생들의 현장경험 축적과 산업체 취업 유도하고 있다.

국내외 약용식물의 세포 및 기관을 생물반응기에서 배양하여 다양한 유용물질을 생산하고 이를 식품원료로 산업화 하였다. 현재 기능성 식품 및 의약품 원료로 이용하기 위해 다양한 산/학/연 연구가 진행되고 있다.